Po skończeniu szkoły nawiązała współpracę z organizacją charytatywną Samaritans, występując w ich kampaniach społecznych. Na małym ekranie zadebiutowała małą rólka w serialu "Lekarze". Zagrała też w telewizyjnym filmie "Atak dinozaurów". Przełomem okazała się jednak dla niej rola Daenerys Targaryen w serialu HBO "Gra o tron". Później wystąpiła jeszcze w takich filmach jak: "Terminator: Genisys", "Zanim się pojawiłeś" czy "Han Solo: Gwiezdne wojny - historie".

"Gra o tron" to jeden z najchętniej oglądanych seriali w historii telewizji. Produkcja HBO przyniosła ogromną popularność odtwórcom głównych ról. To właśnie dzięki "Grze o tron" rozpędu nabrała kariera Kita Haringtona, Sophie Turner, Leny Headey czy Emilii Clarke. Dla tej ostatniej praca na planie była jak chrzest bojowy.

Obie jesteśmy naiwne i młode, nasze życie dopiero się zaczyna. Czasem mam wrażenie, jakbyśmy wychowywały i razem uczyły - tak Emilia Clarke porównała kilka lat temu swoją osobę do kreowanej w serialu postaci.

Daenerys Targaryen to najmłodsze dziecko ostatniego władcy Siedmiu Królestw z dynastii Targaryenów, króla Aerysa II Targaryena. Nielękająca się ognia, Matka Smków. Nawet śmierć męża, khala Drogo, nie powstrzymała jej przed opracowaniem strategii powrotu do Siedmiu Królestw w celu odzyskania Żelaznego Tronu.

Emilia Clarke w 2011 roku